防衛大学校では１年生は理工系と人社系で分けられており、２年生に進級するときに専門学科に振り分けられます。応用化学科では、２年生以上の学生に対して、化学の基礎から応用に至る幅広い専門科目を展開しています。

  さらに、教養科目（理工系および人社系）と理工系の学生全員が受講する専門基礎科目も担当しています。2012年度から始まっている教育プログラムについては、教育課程のページを参照してください。

教養教育

理工系：基礎ゼミナール（１年生），火薬概論（４年生），分子生物学とバイオテクノロジー（４年生）

人社系：基礎ゼミナール（１年生），化学序論（２年生），自然科学実験（３年生），火薬概論（４年生），分子生物学とバイオテクノロジー（４年生）

専門基礎

理工系（１年生）：化学Ⅰ，化学Ⅱ，基礎科学実験，化学実験

理工系（２年生）：生物化学